ومما يَدُلّ على قيمة كتاب العقيقي العلمية وأثره في المؤرخين بعده: أثره في الحافظ المزي حيث ما يكاد يذكره إلا ويلقبه بالنسابة كما نقَل عنه المزي في ترجمة لـ موسى بن جعفر بن محمد: "حيث قال: قال يحيى بن الحسن بن جعفر النسابة: كان موسى بن جعفر يدعى العبد الصالح؛ من عبادته واجتهاده" (١). وهذا النقل موافق لما جاء في كتاب أخبار المدينة، كما اتضح أثره أيضا على كل من الحافظ المؤرخ ابن حجر العسقلاني، والإمام الحافظ شمس الدين الذهبي فيما سبق.
وكما أنّ كتاب يحيى (أخبار المدينة) صار مورًا للمؤرخين من بعده، فكذلك صار مرجعًا لغيرهم من بقية أهل الفنون كالعقيدة والفقه؛ فقد نقَل عنه الإمام الآجري (٢) في كتابه كتاب الشريعة، بل ووصفه فقال: